Nell'anno 800 Casciana si chiamava Castrum ad Aquis, già conosciuto per le sue acque termali, appartenne fino al 1100 al Conte Ugone. 
Fu donata alla Chiesa di Morrona e ai frati Camandolesi che la donarono all'Arcivescovato di Pisa nel 1135. 
Vide la guerra con i Fiorentini che la incendiarono nel 1362 e la annessero alla Repubblica Fiorentina  nel 1515, che la trasferì poi al Vicariato di Peccioli e successivamente a quello di Lari nel 1776.
Negli anni successivi il paese si sviluppa intorno alle Terme, vengono costruite ville importanti per famiglie di nobile casato si costruiscono nuovi alberghi fra cui il Gran Hotel delle Terme inaugurato nel 1912. 
Casciana Terme diventa Comune nel 1927 e continua con grande successo la sua vocazione Turistico -Termale fino al ai nostri giorni.